More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0600 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.07 
 
 
275 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.51 
 
 
275 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.91 
 
 
275 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.01 
 
 
275 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 
273 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
276 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
415 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.2 
 
 
273 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 
283 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 
292 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 
285 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
614 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0250  methyl-accepting chemotaxis protein  44.88 
 
 
518 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  34.78 
 
 
541 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  40.26 
 
 
701 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
579 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
579 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
579 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 
557 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
579 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
708 aa  95.9  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  42.28 
 
 
700 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  42.28 
 
 
700 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  42.28 
 
 
700 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
447 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 
579 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
640 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3052  methyl-accepting chemotaxis protein  40.44 
 
 
579 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
543 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
625 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
627 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
543 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  37.27 
 
 
656 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
540 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  41.55 
 
 
547 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
897 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
535 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
543 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 
579 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
700 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
384 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
543 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
535 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  32.02 
 
 
541 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  42.52 
 
 
566 aa  92.8  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
656 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
543 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
543 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
543 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
543 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
720 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.63 
 
 
530 aa  92.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 
540 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 
653 aa  92  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 
540 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
533 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.9 
 
 
607 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  39.61 
 
 
558 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
522 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  31.67 
 
 
535 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  40.48 
 
 
604 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
619 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 
533 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.73 
 
 
701 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
613 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 
822 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  42.25 
 
 
553 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
563 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
518 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  43.86 
 
 
641 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  34.59 
 
 
714 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
415 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 
563 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 
649 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.71 
 
 
433 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2237  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 
661 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.551171  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
548 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
650 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  43.31 
 
 
365 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 
539 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
621 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
661 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
705 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  32.99 
 
 
661 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05387  histidine kinase  41.67 
 
 
589 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
700 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  44.95 
 
 
655 aa  89.4  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  44.95 
 
 
655 aa  89.4  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
547 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
775 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
674 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>