More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3464 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
525 aa  1060    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1108  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
539 aa  334  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
540 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.289047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
555 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2526  methyl-accepting chemotaxis protein  41.72 
 
 
559 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  38.75 
 
 
575 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
538 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.170942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  39.92 
 
 
538 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662156  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4317  chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 
572 aa  269  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02969  Methyl-accepting chemotaxis protein  34.91 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0476708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2191  methyl-accepting chemotaxis protein  30.89 
 
 
666 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1872  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
542 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2146  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
542 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0285  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
563 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.877776  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1169  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
542 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0379  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 
542 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0881  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
661 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1733  methyl-accepting chemotaxis protein I  31.25 
 
 
661 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1234  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  31.3 
 
 
514 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 
508 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  39.01 
 
 
712 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.01 
 
 
712 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 
713 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 
511 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51282  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
716 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 
674 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 
638 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
405 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  32.38 
 
 
539 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 
640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.82 
 
 
523 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 
541 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  34.44 
 
 
545 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  30.95 
 
 
521 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
547 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
671 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
676 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.19 
 
 
555 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
541 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.85 
 
 
626 aa  169  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 
645 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
541 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2398  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 
656 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.201842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
544 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.24 
 
 
526 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
541 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.54 
 
 
626 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 
548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  30.13 
 
 
521 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
637 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 
579 aa  167  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  30.02 
 
 
547 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 
541 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
638 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.29 
 
 
628 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  33.62 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 
628 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 
541 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 
541 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  33.68 
 
 
642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.34 
 
 
626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.29 
 
 
643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 
650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.42 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  37.54 
 
 
626 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 
645 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 
550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 
541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  33.05 
 
 
638 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 
637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.14 
 
 
545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 
830 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 
541 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
572 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 
674 aa  163  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  33.15 
 
 
652 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  30.46 
 
 
541 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 
497 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
643 aa  163  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  29.47 
 
 
568 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.78 
 
 
544 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 
639 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 
531 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
545 aa  163  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
645 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 
547 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  32.49 
 
 
633 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
629 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  39.68 
 
 
521 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
568 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  27.71 
 
 
544 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 
541 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>