More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001261 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 547 aa  1095    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  87.02 
 
 		 558 aa  954    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  61.97 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  47.88 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  46.25 
 
 		 542 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  45.52 
 
 		 542 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  45.27 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  41.14 
 
 		 543 aa  246  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 		 661 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.06 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  43.33 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.28 
 
 		 712 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.99 
 
 		 712 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 716 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 541 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 637 aa  210  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.27 
 
 		 546 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  36.98 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 		 544 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 638 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 		 543 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 541 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 653 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 713 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 541 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  37.03 
 
 		 672 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 637 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.32 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  37.73 
 
 		 547 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 		 539 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 541 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  34.58 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 		 555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  33.99 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 550 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 541 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.39 
 
 		 640 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 		 642 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 642 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 674 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 541 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 541 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 715 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 545 aa  193  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 739 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 		 573 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  36.54 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  36.54 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.66 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 647 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  30.76 
 
 		 546 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 714 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 541 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  37.47 
 
 		 541 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 542 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 619 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  32.91 
 
 		 633 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  35.1 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  35.26 
 
 		 647 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 647 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 411 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 554 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 		 539 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 632 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 		 541 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 547 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 547 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>