More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1032 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  100 
 
 
375 aa  754    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  63.3 
 
 
365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  63.56 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  46.38 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.99 
 
 
720 aa  230  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
720 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
357 aa  209  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
421 aa  205  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  39.34 
 
 
360 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
361 aa  192  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  41.2 
 
 
306 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 
632 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
447 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 
635 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
483 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
440 aa  156  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  38.22 
 
 
459 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  38.67 
 
 
459 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  38.67 
 
 
459 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  39.13 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  33.55 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.4 
 
 
366 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 
367 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  32.81 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 
372 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 
362 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  35.9 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  30.79 
 
 
361 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  30.53 
 
 
362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
649 aa  122  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  37.93 
 
 
663 aa  122  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  38.43 
 
 
654 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 
700 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  39.64 
 
 
656 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
362 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  49.62 
 
 
652 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 
658 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 
664 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  49.31 
 
 
651 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  49.62 
 
 
545 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  45.39 
 
 
655 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  58.72 
 
 
654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 
483 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  45.39 
 
 
655 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  67.9 
 
 
553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  48.85 
 
 
544 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  48.85 
 
 
596 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  38.46 
 
 
661 aa  117  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
362 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.49 
 
 
626 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436733  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
659 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
659 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
653 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
664 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  40.19 
 
 
604 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
665 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  49.24 
 
 
657 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  71.23 
 
 
700 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  71.23 
 
 
700 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  71.23 
 
 
700 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 
495 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 
775 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.21 
 
 
658 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  54.81 
 
 
731 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.33 
 
 
698 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.13 
 
 
811 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  30.25 
 
 
645 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
633 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  56.25 
 
 
662 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 
536 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  44.3 
 
 
656 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  42.96 
 
 
431 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  55.75 
 
 
660 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  55.75 
 
 
656 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
695 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00207311  hitchhiker  0.0002457 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  55.75 
 
 
678 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.18 
 
 
695 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  55.75 
 
 
658 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.1 
 
 
682 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  55.75 
 
 
657 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 
563 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  45.53 
 
 
653 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0105  MCP-domain signal transduction protein  32.59 
 
 
381 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000762426  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  41.48 
 
 
429 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>