More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4516 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 285 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.39 
 
 		 285 aa  308  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.15 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0418  methyl-accepting chemotaxis protein  50.53 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  50.53 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0470  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.47 
 
 		 430 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0370  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0405  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 		 430 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 		 415 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4939  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 		 500 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  34.8 
 
 		 563 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 		 563 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 		 661 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 		 655 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5317  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 		 500 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  34.8 
 
 		 563 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 525 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5214  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 500 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4782  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 		 500 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4800  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 		 500 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.3 
 
 		 695 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 		 566 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5184  methyl-accepting chemotaxis protein  44.35 
 
 		 500 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 500 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  34.31 
 
 		 563 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 566 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5233  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 500 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 572 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.54 
 
 		 656 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4905  methyl-accepting chemotaxis protein  35.57 
 
 		 563 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.54 
 
 		 661 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  48.45 
 
 		 689 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5280  methyl-accepting chemotaxis protein  35.57 
 
 		 563 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5218  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.315726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0030  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0163545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.54 
 
 		 656 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.05 
 
 		 523 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  41.26 
 
 		 731 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 566 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5181  methyl-accepting chemotaxis protein  33.82 
 
 		 563 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000942928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 512 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 567 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0927  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 		 572 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 530 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 		 614 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.0279e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 662 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 651 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 664 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 653 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 665 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  43.55 
 
 		 700 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 540 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 659 aa  85.9  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 538 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 653 aa  86.3  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 659 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  43.55 
 
 		 700 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3508  aerotaxis receptor  32.24 
 
 		 506 aa  85.9  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  43.55 
 
 		 700 aa  85.9  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 		 957 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3366  aerotaxis receptor  32.24 
 
 		 506 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.775088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3538  aerotaxis receptor  32.24 
 
 		 506 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 967 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0176673  normal  0.174359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02941  fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component  33.13 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.13 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  41.73 
 
 		 641 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02891  hypothetical protein  33.13 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3253  aerotaxis receptor  33.13 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4385  aerotaxis receptor  32.24 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.472426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.24 
 
 		 506 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  39.42 
 
 		 569 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3867  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 		 572 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  37.27 
 
 		 654 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 707 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  38.56 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  41.86 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>