More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1639 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
566 aa  1111    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 
571 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 
565 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 
564 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 
571 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 
572 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.17 
 
 
588 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 
573 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.23 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 
574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 
557 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  36.24 
 
 
658 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 
525 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 
658 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 
658 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 
658 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 
660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 
660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 
676 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.9 
 
 
658 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
661 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 
658 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 
658 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 
658 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 
660 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  37.61 
 
 
658 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  34.92 
 
 
660 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  37.57 
 
 
660 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.1 
 
 
695 aa  210  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 
660 aa  210  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  37.3 
 
 
660 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  37.3 
 
 
660 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  37.3 
 
 
660 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  34.39 
 
 
650 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 
425 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 
520 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
596 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 
561 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  34.39 
 
 
660 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  37.32 
 
 
658 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 
660 aa  207  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.51 
 
 
650 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.62 
 
 
660 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.02 
 
 
568 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000211004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 
660 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
660 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.39 
 
 
650 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  34.39 
 
 
650 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  30.78 
 
 
579 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  34.43 
 
 
689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
660 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
572 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 
678 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 
588 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0528204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  29.33 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.63 
 
 
563 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 
659 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 
548 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4905  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 
563 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5280  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 
563 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  29.15 
 
 
563 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  29.15 
 
 
563 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  29.15 
 
 
563 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4649  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
653 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.9 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.98 
 
 
657 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 
528 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
430 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 
415 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 
528 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 
713 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  27.9 
 
 
544 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  30.79 
 
 
666 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  32.93 
 
 
564 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 
564 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  32.93 
 
 
564 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5181  methyl-accepting chemotaxis protein  29.15 
 
 
563 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000942928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
658 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 
426 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  30.28 
 
 
666 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  26.96 
 
 
574 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 
426 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1439  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 
571 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.181327  hitchhiker  0.0000921474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 
417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  32.93 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>