More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4636 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
356 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 
285 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.52 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0470  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.42 
 
 
430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0405  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 
430 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 
430 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 
430 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0370  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 
430 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0418  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
430 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
430 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 
430 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
284 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 
655 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 
655 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
273 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  42.38 
 
 
651 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 
273 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01599  hypothetical protein  39.88 
 
 
483 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  39.49 
 
 
663 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
276 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
431 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
275 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
283 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 
649 aa  97.8  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 
555 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127985 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  47.32 
 
 
731 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
276 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  50.98 
 
 
689 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  38.12 
 
 
654 aa  96.3  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
275 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  39.13 
 
 
578 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  44.19 
 
 
700 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  44.25 
 
 
604 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0139  methyl-accepting chemotaxis protein  44.63 
 
 
650 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  44.19 
 
 
700 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  44.19 
 
 
700 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 
663 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  35.36 
 
 
694 aa  94.4  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
583 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  47.66 
 
 
672 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.65 
 
 
665 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 
544 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
492 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34192  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
541 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 
640 aa  92.8  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
483 aa  92.8  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.28 
 
 
660 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 
627 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
537 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
661 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
653 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  40.77 
 
 
553 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  38.21 
 
 
524 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487789  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 
545 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 
653 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 
647 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 
638 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1789  chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
546 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.478165  decreased coverage  0.000703042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
537 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
661 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
652 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
545 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 
625 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.62 
 
 
545 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
545 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  42.98 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  42.98 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
437 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
545 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 
545 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
656 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
463 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.876228  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 
463 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.246306  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
656 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  42.98 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.02 
 
 
523 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
639 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3685  methyl-accepting chemotaxis protein  40.62 
 
 
546 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  43.38 
 
 
638 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 
621 aa  90.5  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
566 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
275 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
639 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 
546 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 
542 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
639 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
682 aa  90.1  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  42.5 
 
 
654 aa  90.1  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 
655 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
545 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
545 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
545 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>