More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1294 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  56.86 
 
 
674 aa  744    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
663 aa  1337    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  60.33 
 
 
672 aa  801    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  57.92 
 
 
663 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  31.47 
 
 
666 aa  238  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 
674 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
544 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
544 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
544 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
552 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  30.24 
 
 
539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  27.54 
 
 
674 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  39.39 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.81 
 
 
653 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
640 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
544 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
637 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
634 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
636 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  29.75 
 
 
634 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2237  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
661 aa  194  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.551171  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 
640 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  35.69 
 
 
653 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  34.45 
 
 
629 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 
638 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
541 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
572 aa  191  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  35.16 
 
 
636 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 
634 aa  191  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 
638 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
541 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.98 
 
 
638 aa  190  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  36.55 
 
 
661 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 
674 aa  190  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
573 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
650 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 
621 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 
572 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
573 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 
639 aa  188  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
573 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  32.96 
 
 
712 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 
549 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.47 
 
 
695 aa  187  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 
623 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 
672 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 
634 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 
674 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.92 
 
 
559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  32.96 
 
 
712 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  34.86 
 
 
623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.89 
 
 
675 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 
675 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 
548 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.67 
 
 
539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1108  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 
647 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
673 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 
540 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.289047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
647 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
739 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  32.96 
 
 
541 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 
673 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 
541 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.37 
 
 
521 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 
549 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
540 aa  183  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
637 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 
521 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  34.37 
 
 
521 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  35.37 
 
 
541 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 
773 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
552 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.55 
 
 
650 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 
697 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 
830 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.37 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 
716 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.63 
 
 
545 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  34.83 
 
 
521 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 
549 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 
649 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 
543 aa  181  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 
713 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 
539 aa  180  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 
675 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
654 aa  180  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.84 
 
 
539 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
638 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  34.55 
 
 
521 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
540 aa  179  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>