More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1436 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3052  methyl-accepting chemotaxis protein  93.26 
 
 		 579 aa  1105    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.81 
 
 		 579 aa  1070    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.98 
 
 		 579 aa  1053    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.98 
 
 		 579 aa  1053    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 579 aa  1179    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.65 
 
 		 579 aa  1173    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.16 
 
 		 579 aa  1054    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  46.89 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 602 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2522  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  38.44 
 
 		 605 aa  256  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000107886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1025  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  38.04 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0126152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1754  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.99 
 
 		 570 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1794  methyl-accepting chemotaxis protein  37.99 
 
 		 644 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1967  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.84 
 
 		 728 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1813  methyl-accepting chemotaxis protein  37.84 
 
 		 728 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1267  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.84 
 
 		 728 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0141  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.84 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 		 568 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 606 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1118 aa  187  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 671 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 739 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 		 647 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 647 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 541 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 619 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 639 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 773 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 620 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 620 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 621 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 620 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 620 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 620 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3838  methyl-accepting chemotaxis protein  37.66 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  35.88 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 620 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.733563  normal  0.773778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 638 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 620 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  33.75 
 
 		 578 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 555 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 		 552 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.912748  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.69 
 
 		 648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 		 640 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  36.9 
 
 		 640 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.16 
 
 		 688 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 638 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  34.2 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 		 647 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 620 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 552 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  33.52 
 
 		 564 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 620 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 646 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 642 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 638 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 688 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 688 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1108  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 640 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.15 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 714 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 638 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 637 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 640 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.51 
 
 		 647 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 545 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 543 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 541 aa  157  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 646 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 		 620 aa  157  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.15 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 568 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 545 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 545 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>