47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5746 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5746  response regulator receiver protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6803  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5538  response regulator receiver protein  33 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.928503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0330  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.79 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2206  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0547033  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.68 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0682  response regulator receiver protein  20.92 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000269767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.56 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 236 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.96 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.67 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1010  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 161 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3124  LytTr DNA-binding region  32.95 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.55 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1834  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.36 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  23.08 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  30.91 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  31.87 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3964  hypothetical protein  28.7 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.41 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  31.71 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.29 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  21.88 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  25.26 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3052  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.995859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  28.47 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.73 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  29.29 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.2 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4564  LytTR family two component transcriptional regulator  25.24 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0221995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  27.07 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  26.88 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>