More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0033 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
365 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0032  Lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 
413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 
355 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  51.76 
 
 
276 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
259 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  43.94 
 
 
279 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2304  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0157  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12858  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.7 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  40.93 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  44.52 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  42.33 
 
 
562 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 
281 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  45.31 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  44.03 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  42.25 
 
 
495 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  51.38 
 
 
451 aa  109  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  36.26 
 
 
451 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 
547 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 
447 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  38.57 
 
 
849 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  40.37 
 
 
523 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 
733 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  38.41 
 
 
516 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  43.17 
 
 
440 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  38.65 
 
 
516 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.61 
 
 
543 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  46.36 
 
 
383 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  40.13 
 
 
522 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.51 
 
 
530 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.51 
 
 
530 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.51 
 
 
530 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.51 
 
 
530 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  38.51 
 
 
552 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.51 
 
 
553 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  37.2 
 
 
451 aa  99.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  39.71 
 
 
415 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 
304 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.16 
 
 
617 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  41.01 
 
 
612 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.01 
 
 
612 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.91 
 
 
801 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
620 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.65 
 
 
554 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.86 
 
 
527 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40 
 
 
1001 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1021  lytic transglycosylase, catalytic  38.62 
 
 
477 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.847474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
1021 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  39.72 
 
 
570 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.89 
 
 
530 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 
693 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  33.5 
 
 
650 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 
618 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 
553 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  36.84 
 
 
507 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.27 
 
 
531 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  31.46 
 
 
518 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  38.15 
 
 
570 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 
556 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  36.25 
 
 
580 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  38.16 
 
 
403 aa  96.3  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 
524 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  37.5 
 
 
557 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  29.48 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.73 
 
 
552 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 
610 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 
539 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 
596 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.26 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  37.75 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
527 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  36.02 
 
 
587 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  37.37 
 
 
501 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 
517 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
518 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.22 
 
 
528 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  35.19 
 
 
583 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  34.85 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.26 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 
661 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  36.02 
 
 
524 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
544 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 
528 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 
550 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 
511 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 
509 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.42 
 
 
495 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  35.22 
 
 
524 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 
529 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 
507 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.76 
 
 
406 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  34.64 
 
 
499 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.62 
 
 
564 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  35.4 
 
 
525 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>