264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0157 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0157  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
312 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 
324 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12858  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 
311 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 
365 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  37.97 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0032  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 
413 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  45.71 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 
355 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  34.18 
 
 
281 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  34.53 
 
 
523 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2304  Lytic transglycosylase catalytic  47.89 
 
 
358 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  38.67 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  29.6 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  34.74 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.55 
 
 
801 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  30.57 
 
 
498 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  39.72 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  32.69 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  32.55 
 
 
499 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
405 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  31.75 
 
 
849 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  29.36 
 
 
506 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 
499 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1403  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 
401 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  30.34 
 
 
620 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  42.74 
 
 
372 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  32.99 
 
 
484 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 
487 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  43.55 
 
 
372 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  43.55 
 
 
372 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  30.13 
 
 
419 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  30.15 
 
 
440 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  32.44 
 
 
733 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 
507 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  36.49 
 
 
495 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  31.8 
 
 
618 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.56 
 
 
617 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  36.81 
 
 
403 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 
448 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  38.19 
 
 
403 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
544 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  34.22 
 
 
415 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  38.85 
 
 
383 aa  99.4  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 
547 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  30.05 
 
 
322 aa  99  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 
595 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  44.79 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.63 
 
 
543 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.95 
 
 
457 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.56 
 
 
457 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.33 
 
 
451 aa  95.9  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 
596 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.48 
 
 
472 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  32.63 
 
 
487 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.48 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.63 
 
 
499 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  31.94 
 
 
693 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 
539 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.48 
 
 
459 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0565  hypothetical protein  27.78 
 
 
474 aa  93.6  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.78 
 
 
426 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 
573 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  35.21 
 
 
516 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  35.21 
 
 
516 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 
544 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.73 
 
 
464 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  32.96 
 
 
501 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 
587 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.97 
 
 
465 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  35.03 
 
 
562 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  34.01 
 
 
451 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.43 
 
 
1001 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.16 
 
 
538 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 
1021 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  28.63 
 
 
638 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
518 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 
514 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  29.9 
 
 
583 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 
517 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.85 
 
 
527 aa  89.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  27.4 
 
 
522 aa  89.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 
578 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
573 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.37 
 
 
547 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
475 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 
504 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  34.69 
 
 
530 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  34.69 
 
 
552 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.69 
 
 
530 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  34.69 
 
 
531 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  35.14 
 
 
572 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  32.53 
 
 
467 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 
515 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 
511 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.69 
 
 
530 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.69 
 
 
553 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.64 
 
 
406 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 
524 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>