More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1403 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1403  membrane-bound lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 401 aa  797    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2403  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  51.89 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  39.62 
 
 		 446 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.73 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  36.5 
 
 		 534 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.11 
 
 		 552 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.5 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.64 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  40.51 
 
 		 473 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.46 
 
 		 515 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.46 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 		 548 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  37.99 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  39.05 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  38.41 
 
 		 476 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.45 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.17 
 
 		 554 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  34.77 
 
 		 580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  39.08 
 
 		 507 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  37.13 
 
 		 553 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.81 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  38.43 
 
 		 442 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  38.43 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.9 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.9 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  33.1 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.87 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.08 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.92 
 
 		 527 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.24 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.22 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  39.43 
 
 		 562 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.87 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  37.02 
 
 		 550 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.32 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.29 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  35.08 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  37.86 
 
 		 487 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.86 
 
 		 499 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  32.76 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  37.8 
 
 		 483 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  37.8 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.89 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  37.4 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  37.4 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  38.49 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.69 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 515 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  37.88 
 
 		 516 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  37.88 
 
 		 516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  35.43 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  36.33 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  35.5 
 
 		 518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  36.33 
 
 		 525 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  36.33 
 
 		 525 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  36.11 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 		 527 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 528 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  35.43 
 
 		 474 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 		 561 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  34.98 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  35.43 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  35.04 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  34.11 
 
 		 524 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  35.43 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  35.04 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  35.43 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  35.43 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 570 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  35.04 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  35.04 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  36.78 
 
 		 511 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.36 
 
 		 531 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 		 529 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  35.43 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  34.98 
 
 		 530 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 564 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.98 
 
 		 530 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 474 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>