More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0032 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0032  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
413 aa  850    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  38.68 
 
 
365 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  47.51 
 
 
276 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 
355 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2304  Lytic transglycosylase catalytic  47.74 
 
 
358 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 
279 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 
324 aa  159  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12858  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.85 
 
 
311 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  40.61 
 
 
451 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0157  lytic murein transglycosylase  43.97 
 
 
312 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  27.66 
 
 
377 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 
523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.01 
 
 
442 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
379 aa  106  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  46.55 
 
 
733 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  39.87 
 
 
557 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
322 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 
405 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 
570 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  40.94 
 
 
495 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.64 
 
 
547 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  39.57 
 
 
547 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  36.88 
 
 
562 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  37.58 
 
 
516 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 
512 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  38.18 
 
 
451 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  38.1 
 
 
383 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  36.97 
 
 
516 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.44 
 
 
1001 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.83 
 
 
620 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 
1021 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  46.79 
 
 
451 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 
1079 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000744  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.24 
 
 
248 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.2 
 
 
498 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 
504 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 
618 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 
504 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1403  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.48 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  40.12 
 
 
514 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36.9 
 
 
530 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.9 
 
 
530 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 
518 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.9 
 
 
530 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  37.25 
 
 
501 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  36.9 
 
 
552 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.9 
 
 
553 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1021  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 
477 aa  97.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.847474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 
530 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  35.91 
 
 
467 aa  96.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 
578 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  37.67 
 
 
523 aa  96.3  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 
538 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36.9 
 
 
531 aa  96.3  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 
509 aa  96.3  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
693 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 
564 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 
587 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 
564 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
515 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 
527 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 
530 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
524 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  37.42 
 
 
524 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  37.5 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 
528 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 
447 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
511 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  32.32 
 
 
580 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04905  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.82 
 
 
225 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
440 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 
561 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.81 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 
498 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.14 
 
 
372 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  40.65 
 
 
522 aa  93.2  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  35.22 
 
 
446 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  35.62 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  37.9 
 
 
403 aa  92  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.03 
 
 
544 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
529 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 
499 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  34.34 
 
 
638 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
596 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.14 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 
529 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  35.62 
 
 
507 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  44.04 
 
 
650 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
499 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.48 
 
 
543 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  36 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 
525 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 
525 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.98 
 
 
617 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  30.18 
 
 
555 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>