More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1814 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  45.85 
 
 
355 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0032  Lytic transglycosylase catalytic  47.51 
 
 
413 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  51.76 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  43.01 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  44.06 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 
324 aa  153  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2304  Lytic transglycosylase catalytic  41.87 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
377 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  37.62 
 
 
419 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 
523 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12858  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40 
 
 
311 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 
451 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 
322 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0157  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 
312 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
405 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  36.84 
 
 
495 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
596 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 
523 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 
498 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000744  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.12 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 
733 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  42.42 
 
 
451 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
661 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.32 
 
 
543 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.93 
 
 
530 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  36.93 
 
 
534 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  36.13 
 
 
476 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  36.13 
 
 
476 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  38.64 
 
 
516 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
570 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
650 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  38.07 
 
 
516 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  38.32 
 
 
562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04905  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40 
 
 
225 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
522 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  35.6 
 
 
473 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  35.08 
 
 
476 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  35.45 
 
 
511 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.9 
 
 
547 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  37.58 
 
 
451 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.01 
 
 
1001 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 
1021 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  36.42 
 
 
383 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 
447 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 
379 aa  106  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  43.38 
 
 
620 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  33.67 
 
 
552 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.67 
 
 
530 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  37.67 
 
 
556 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.67 
 
 
530 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  29.3 
 
 
524 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.67 
 
 
530 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.67 
 
 
553 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 
561 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 
530 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  31.48 
 
 
557 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.66 
 
 
515 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  34.05 
 
 
524 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 
570 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  31.05 
 
 
517 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 
504 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 
530 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 
610 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  32.98 
 
 
504 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 
529 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 
525 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 
529 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 
528 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36.31 
 
 
531 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 
525 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 
525 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.15 
 
 
552 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 
564 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  35.88 
 
 
492 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 
467 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.51 
 
 
564 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.09 
 
 
534 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 
518 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 
509 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 
638 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.16 
 
 
544 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  31.77 
 
 
511 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36 
 
 
372 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.2 
 
 
495 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 
1079 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  37.06 
 
 
518 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  33.67 
 
 
446 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 
485 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36 
 
 
372 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36 
 
 
372 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
512 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 
561 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 
498 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  38.97 
 
 
403 aa  99.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  37.34 
 
 
849 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 
515 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 
448 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>