276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12858 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12858  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  100 
 
 
311 aa  636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  53.58 
 
 
324 aa  358  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  42.35 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0157  lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 
419 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  43.98 
 
 
279 aa  178  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0033  Lytic transglycosylase catalytic  46.7 
 
 
365 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
355 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
276 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0032  Lytic transglycosylase catalytic  34.85 
 
 
413 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  43.72 
 
 
259 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2304  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 
358 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
447 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  38.55 
 
 
595 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  36.4 
 
 
495 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  36.06 
 
 
618 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 
498 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.98 
 
 
733 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 
499 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  35.18 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  34.94 
 
 
506 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  37.93 
 
 
484 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 
487 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  38.68 
 
 
498 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  33.72 
 
 
583 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  34.98 
 
 
499 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 
448 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 
638 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  37.67 
 
 
507 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 
281 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 
544 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.68 
 
 
617 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 
547 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0523  hypothetical protein  33.85 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 
573 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 
587 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  33.48 
 
 
523 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  35.75 
 
 
572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 
451 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  34.98 
 
 
620 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  36.41 
 
 
516 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  36.41 
 
 
516 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0565  hypothetical protein  28.33 
 
 
474 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  35.14 
 
 
403 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  34.7 
 
 
573 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
415 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  33.65 
 
 
507 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  38.85 
 
 
562 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  35.33 
 
 
451 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
495 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 
518 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  31.08 
 
 
403 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  33.18 
 
 
405 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.65 
 
 
801 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  42.65 
 
 
451 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  35.94 
 
 
556 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
578 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1403  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
401 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.71 
 
 
596 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 
379 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 
509 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
372 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.48 
 
 
1001 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 
504 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 
504 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  33.48 
 
 
1021 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  36.41 
 
 
557 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  34.83 
 
 
383 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.84 
 
 
544 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  36.41 
 
 
570 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 
550 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.98 
 
 
372 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  32.87 
 
 
523 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  35.11 
 
 
446 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.79 
 
 
457 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  32.74 
 
 
372 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  34.8 
 
 
511 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  37.13 
 
 
555 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 
693 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  35.86 
 
 
650 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.04 
 
 
395 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  36.41 
 
 
564 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  32.57 
 
 
442 aa  98.2  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  35.87 
 
 
528 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.48 
 
 
472 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  35.87 
 
 
524 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 
849 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 
564 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  33.98 
 
 
524 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.48 
 
 
459 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.27 
 
 
530 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 
525 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.87 
 
 
534 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  35.33 
 
 
552 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.33 
 
 
530 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.33 
 
 
553 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 
530 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.33 
 
 
530 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 
538 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>