More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89386 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  75.54 
 
 		 445 aa  655    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  84.28 
 
 		 451 aa  727    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  100 
 
 		 419 aa  863    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  73.8 
 
 		 491 aa  614  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  55.26 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  53.35 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  50.82 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  49.73 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  50 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  49.73 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  48.96 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  49.47 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  48.77 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  37.99 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  35.22 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  34.02 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  35.34 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  34.84 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  33.76 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  33.99 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  33.51 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  34.51 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  33.52 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  35.59 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  33.95 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  33.78 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  33.07 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  32.57 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.8 
 
 		 514 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  31.79 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  33.79 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  32.67 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  33.07 
 
 		 514 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  32.43 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  34.01 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.77 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  32.89 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  32.12 
 
 		 522 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  32.76 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  30.46 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  32.29 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  33.52 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  33.15 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  32.95 
 
 		 485 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.8 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  32.13 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.31 
 
 		 505 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  30.52 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  31.86 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  32.35 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  33.24 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  32.13 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.24 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  32.97 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  32.26 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  31.3 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  32.53 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  31.23 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  32.19 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  32.96 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  31.25 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  32.21 
 
 		 448 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  31.71 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  32.27 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28.77 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  29.59 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  32.36 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  33.79 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  32.95 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  30.33 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  31.13 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  33.24 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  29.24 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.07 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.51 
 
 		 504 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  31.02 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  30.74 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  32.24 
 
 		 503 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  29.94 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  29.1 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  29.63 
 
 		 499 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4159  isopropylmalate/homocitrate synthase  34.11 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  31.82 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  27.45 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  34.01 
 
 		 377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  32.18 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  27.09 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  28.8 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  31.03 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  30.41 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  30.16 
 
 		 527 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  29.05 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  27.7 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  31.69 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  29.58 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  30.63 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>