More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0445 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  81.22 
 
 		 412 aa  702    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 413 aa  848    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  31.79 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  34.44 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  31.79 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  32.16 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  31.25 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  35.22 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  32.6 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  31.64 
 
 		 389 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  33.91 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  30.11 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  30.3 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  30.03 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  30.03 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  31.36 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  30.64 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  30.29 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  31.82 
 
 		 532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  29.95 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.4 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  30.37 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  32.26 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  31.17 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  30.19 
 
 		 516 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  31.01 
 
 		 514 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  28.38 
 
 		 515 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3757  2-isopropylmalate synthase  32.28 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  30.29 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  31.45 
 
 		 515 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  27.95 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  31.64 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  29.47 
 
 		 507 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  29.87 
 
 		 512 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  30.61 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  27.37 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  27.15 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  29.65 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  29.41 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  30.84 
 
 		 515 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  27.25 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  29.69 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  29.26 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  30.56 
 
 		 511 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  28.09 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  31.22 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  30.97 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  29.26 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  28.19 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  31.5 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  28.66 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  30.23 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  28.42 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  27.25 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  29.13 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  32.2 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  27.63 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  28.12 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  28.8 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  28.12 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  31.07 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  29.97 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  28.76 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  29.71 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  30.32 
 
 		 505 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  31.92 
 
 		 513 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  28.14 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  27.96 
 
 		 556 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  28.41 
 
 		 515 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0622  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 523 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  30.89 
 
 		 513 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  27.89 
 
 		 510 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  29.13 
 
 		 513 aa  132  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  30.97 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  28.3 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  29.3 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  27.6 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  28.76 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  29.46 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  29.87 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  27.61 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  28.53 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  28.27 
 
 		 514 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  29.63 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  31.98 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  29.02 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  30.79 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  27.91 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  27.59 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  27.89 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  30.11 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  26.53 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  28.86 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  29.84 
 
 		 516 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  28.61 
 
 		 506 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  27.81 
 
 		 520 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  29.55 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  26.5 
 
 		 475 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>