More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1775 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  62.02 
 
 		 515 aa  635    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 516 aa  1050    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  58.45 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  58.08 
 
 		 507 aa  588  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  58.88 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  60.2 
 
 		 516 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  57.34 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  57.83 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 514 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  57.75 
 
 		 527 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  56.81 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  56.37 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  57.46 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  58.08 
 
 		 517 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  55.82 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  57.26 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  57.2 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  57.46 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  57.4 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.45 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  55.86 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 		 509 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 511 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.09 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  56.71 
 
 		 515 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 		 536 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  56.83 
 
 		 519 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  54.24 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 515 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 505 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  54.04 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  54.67 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 514 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 541 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  56.09 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 		 524 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.85 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  57 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 522 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  57 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  54.49 
 
 		 518 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  55.65 
 
 		 515 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  55.34 
 
 		 541 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 		 518 aa  538  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 531 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 522 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  56.01 
 
 		 515 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  56.04 
 
 		 511 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  53.5 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  54.85 
 
 		 516 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  54.11 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 513 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 		 517 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 515 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 513 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  53.85 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  53.31 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 512 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 513 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 		 514 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 		 521 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.87 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  53.78 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 513 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  52.43 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 515 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  54.38 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 		 523 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  52.04 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.74 
 
 		 530 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 		 513 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>