More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1193 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  71.37 
 
 		 520 aa  763    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 504 aa  1028    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  87.65 
 
 		 504 aa  883    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  77.49 
 
 		 506 aa  802    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  72.26 
 
 		 504 aa  779    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  59.24 
 
 		 516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  56.21 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  57.17 
 
 		 527 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  57.72 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.71 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  56.26 
 
 		 514 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.98 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 		 511 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  55.86 
 
 		 516 aa  542  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 		 511 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.83 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  57.26 
 
 		 516 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  54.91 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  55.07 
 
 		 510 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  57.03 
 
 		 516 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  52.83 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 522 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  54 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  52.83 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.27 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  53.98 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.49 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.49 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  53.32 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 517 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.78 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 523 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  54.2 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 514 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  51.95 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  55.71 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  55.71 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  54 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  51.5 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 522 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 516 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 515 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 		 536 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51.91 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 507 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 523 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  49.01 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 521 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  52.58 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  47.96 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  51.66 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 515 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  51.95 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 527 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 510 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 		 546 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  52.78 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>