More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1907 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  72.91 
 
 		 512 aa  752    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 513 aa  1048    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  72.31 
 
 		 512 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  74.1 
 
 		 516 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  70.88 
 
 		 515 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 519 aa  733    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  70.71 
 
 		 518 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  71.29 
 
 		 515 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  58.95 
 
 		 514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  58.87 
 
 		 508 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  58.63 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  62.12 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  57.34 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  57.95 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  58.43 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  61.41 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  58.75 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  57.6 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  57.68 
 
 		 532 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  61.09 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  59.69 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  58.06 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  58.93 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  57.09 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  57.92 
 
 		 524 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  60.28 
 
 		 513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  59.34 
 
 		 516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  58.46 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  58.85 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  58.18 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  56.04 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  57.98 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  59.84 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  57.94 
 
 		 517 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  55.85 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  57.84 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 507 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  56.66 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  56.53 
 
 		 541 aa  558  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  59.39 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  55.35 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  57.85 
 
 		 515 aa  551  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  56.47 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  56.47 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 		 531 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 527 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  57.95 
 
 		 527 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  56.94 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  56.3 
 
 		 541 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  53.94 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 530 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  55.65 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 524 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  55.65 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  54.62 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  58.3 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 523 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  56.45 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  58.47 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  53.94 
 
 		 532 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  58.3 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  56.25 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 524 aa  538  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  57.14 
 
 		 513 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  54.53 
 
 		 515 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  52.94 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  53.12 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  52.33 
 
 		 522 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  56.34 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 		 524 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 		 526 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  53.18 
 
 		 546 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  56.14 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  53.02 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 522 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  54.53 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  54.93 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>