More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4446 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  65.21 
 
 		 556 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  63.93 
 
 		 568 aa  707    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 555 aa  1142    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  64.66 
 
 		 556 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  57.91 
 
 		 536 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 		 536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 		 536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  57.3 
 
 		 541 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  56.93 
 
 		 530 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  56.98 
 
 		 531 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  56.29 
 
 		 541 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  55.62 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 		 539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.27 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.69 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 546 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 546 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  52.35 
 
 		 517 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 546 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.49 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  52.47 
 
 		 546 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 525 aa  539  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 536 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 540 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  52.95 
 
 		 540 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 521 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 663 aa  525  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  53.38 
 
 		 511 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  52.82 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  50.96 
 
 		 516 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  51.53 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 507 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  51.36 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 515 aa  505  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  50.48 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  50.87 
 
 		 515 aa  501  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  51.15 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  50.76 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  49.81 
 
 		 624 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.67 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 519 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  50.76 
 
 		 521 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  49.24 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  48.67 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  50.67 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 520 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  48.86 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  49.52 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  50.19 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  49.05 
 
 		 524 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 520 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  50.87 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  48.35 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  48.54 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  48.77 
 
 		 524 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  48.26 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  48.96 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  48.93 
 
 		 523 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  48.56 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  50.57 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  48.18 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  50.86 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>