More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2141 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  82.17 
 
 		 519 aa  872    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 519 aa  1058    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  61.12 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 		 536 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 		 536 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  55.11 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  55.11 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  55.11 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 509 aa  531  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.01 
 
 		 525 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 517 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 541 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.99 
 
 		 530 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  55.09 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  54.63 
 
 		 540 aa  518  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  50.67 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  50.86 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 507 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  52.82 
 
 		 555 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50.94 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.91 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  50.94 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.93 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 511 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 		 512 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  51.92 
 
 		 512 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 528 aa  495  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  51.21 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 516 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.62 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 512 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  51.72 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 520 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 519 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  52.53 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  51.04 
 
 		 536 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  49.1 
 
 		 519 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  49.62 
 
 		 546 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  49.04 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 521 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  48.99 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>