More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0859 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  91.03 
 
 		 515 aa  954    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 515 aa  1059    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  58.52 
 
 		 506 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  58.32 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  57.92 
 
 		 506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  57.72 
 
 		 506 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  57.72 
 
 		 506 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  57.52 
 
 		 506 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  57.52 
 
 		 506 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  57.52 
 
 		 506 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  58.42 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  57.81 
 
 		 500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  57.81 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  57.68 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 		 507 aa  558  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 508 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.08 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 509 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 511 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54.11 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 503 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 515 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  54.62 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 		 516 aa  511  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 518 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  49.72 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  48.69 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  51.47 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 519 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  51.11 
 
 		 513 aa  495  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 511 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 521 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 530 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 		 519 aa  488  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  47.89 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  47.17 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.21 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  52.45 
 
 		 568 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  47.67 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 515 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  46.79 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  48.51 
 
 		 523 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  46.97 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  47.4 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  48.6 
 
 		 519 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  47.93 
 
 		 518 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  47.78 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  48.05 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  48.22 
 
 		 517 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>