More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1183 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  62.02 
 
 		 516 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 515 aa  1050    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  56.83 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  56.24 
 
 		 541 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 536 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 536 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.92 
 
 		 531 aa  558  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 530 aa  558  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 508 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 505 aa  556  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 		 503 aa  555  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 505 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  56.03 
 
 		 541 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  55.91 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  54.15 
 
 		 512 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.15 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 532 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 514 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  52.94 
 
 		 524 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 511 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 516 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 516 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  54.38 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  55.27 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 		 523 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  53.2 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 516 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 		 546 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 512 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  53.29 
 
 		 536 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.27 
 
 		 509 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  52.25 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 522 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 515 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  54.82 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  55.78 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  53.78 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 518 aa  525  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 527 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  53.88 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  54.79 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  53.25 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  51.88 
 
 		 521 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  51.91 
 
 		 519 aa  524  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.07 
 
 		 509 aa  525  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  54.98 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 520 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  51.86 
 
 		 537 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 540 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  52.34 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  53.88 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  52.28 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 520 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  51.23 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  51.92 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>