More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0561 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  63.28 
 
 		 526 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  65.92 
 
 		 520 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  65.92 
 
 		 520 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  63.58 
 
 		 527 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  64.13 
 
 		 520 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  64.47 
 
 		 519 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 513 aa  1054    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  64.27 
 
 		 520 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  65.66 
 
 		 521 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  63.55 
 
 		 532 aa  670    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  65.31 
 
 		 520 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  63.33 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  63 
 
 		 524 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  60.64 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  60.44 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  61.12 
 
 		 524 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  60.16 
 
 		 524 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  60.55 
 
 		 524 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  59.84 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  59.52 
 
 		 523 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  62.4 
 
 		 524 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  58.52 
 
 		 521 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  60 
 
 		 520 aa  604  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  59.68 
 
 		 524 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  57.43 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  57.31 
 
 		 519 aa  589  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  58.45 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  59.76 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  56.35 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  55.34 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  58.27 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  55.05 
 
 		 519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  54.62 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  57.65 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  56.97 
 
 		 516 aa  555  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  56.66 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.01 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  54.92 
 
 		 511 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  53.47 
 
 		 515 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 		 508 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  57.55 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  55.47 
 
 		 515 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  54.69 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  54.13 
 
 		 511 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.07 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  54.75 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  51.85 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 503 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  53.24 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 		 527 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 		 509 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  51.31 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  51.11 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  52.57 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 515 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.49 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 		 536 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  52.49 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 		 536 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  52.64 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  51.67 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  53.74 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.16 
 
 		 530 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  53.74 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  51.38 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  52.46 
 
 		 515 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>