More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0065 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 518 aa  1066    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.18 
 
 		 532 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  56.57 
 
 		 521 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.88 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  54.88 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 517 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 518 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 508 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 525 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.74 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.48 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 		 541 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.04 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 522 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  53.98 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 		 503 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  52.73 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  51.48 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  51.72 
 
 		 523 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  51.38 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  53.58 
 
 		 541 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.22 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.34 
 
 		 523 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 530 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51.53 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 524 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  50.19 
 
 		 546 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  51.58 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 539 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 520 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  48.41 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  49.01 
 
 		 520 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  51.27 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.1 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 515 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 546 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  52.2 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 512 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  47.91 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 532 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 532 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  47.57 
 
 		 532 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.4 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 546 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 524 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  48 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 521 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 515 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  48.08 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  47.8 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  47.06 
 
 		 521 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>