More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2219 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
499 aa  1011    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  56.54 
 
 
508 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  57.6 
 
 
507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 
525 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.21 
 
 
517 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 
505 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  54.49 
 
 
515 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 
532 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
503 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  54.69 
 
 
515 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 
512 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 
515 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 
509 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 
516 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 
509 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  52.4 
 
 
518 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.2 
 
 
513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 
519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 
508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 
505 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 
505 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  51.2 
 
 
505 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 
510 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 
513 aa  508  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  54.2 
 
 
515 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  52.58 
 
 
513 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 
521 aa  507  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 
511 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 
516 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
536 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 
515 aa  498  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 
556 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 
513 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 
511 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 
523 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 
523 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
541 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 
505 aa  498  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 
527 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  48.55 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 
522 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 
523 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 
511 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 
516 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 
541 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 
515 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 
546 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 
536 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 
536 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 
514 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 
511 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 
516 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 
510 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 
513 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 
509 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 
514 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 
516 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 
515 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 
511 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 
516 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
528 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.62 
 
 
516 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  47.95 
 
 
539 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 
506 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  47.95 
 
 
539 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 
531 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 
540 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 
530 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  48.54 
 
 
555 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 
506 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 
506 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 
527 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 
506 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 
506 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 
506 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  48.28 
 
 
500 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.31 
 
 
522 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 
506 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 
546 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 
524 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 
536 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 
506 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
514 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  46.68 
 
 
507 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  46.88 
 
 
521 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 
512 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  46.57 
 
 
519 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 
513 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  48.97 
 
 
510 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  47.89 
 
 
532 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 
512 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 
546 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  47.87 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  46.37 
 
 
519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>