More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1410 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  72.68 
 
 		 536 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  74.19 
 
 		 540 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  72.66 
 
 		 539 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  82.75 
 
 		 536 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  81.92 
 
 		 531 aa  862    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  74.24 
 
 		 540 aa  766    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  74.62 
 
 		 540 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 546 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 540 aa  1093    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  79.3 
 
 		 530 aa  833    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  82.75 
 
 		 536 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  82.92 
 
 		 541 aa  874    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  72.66 
 
 		 539 aa  775    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  78.08 
 
 		 541 aa  850    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  80.92 
 
 		 536 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  71.76 
 
 		 546 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  71.18 
 
 		 546 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  71.18 
 
 		 546 aa  753    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  61.06 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  61.06 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  61.25 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  58.43 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  57.68 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  57.86 
 
 		 568 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  55.62 
 
 		 555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  57.75 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  56.55 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  56.95 
 
 		 503 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 		 508 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 		 505 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.21 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 507 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 532 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  54.92 
 
 		 511 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  54 
 
 		 509 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  55.95 
 
 		 516 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  54.63 
 
 		 519 aa  534  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  54.8 
 
 		 517 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  54.08 
 
 		 514 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 516 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  55.07 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  55.27 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 510 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 518 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  53.09 
 
 		 522 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  52.04 
 
 		 521 aa  525  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  51.93 
 
 		 522 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 516 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  54.9 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  53.65 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 516 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  54.65 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  51.32 
 
 		 524 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  53.98 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  54.44 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  53.73 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  54.05 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  53.95 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  54.08 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  54.44 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 		 513 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.74 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 513 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  50.96 
 
 		 510 aa  508  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 		 515 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  54.67 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  51.22 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  51.66 
 
 		 518 aa  501  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  54.08 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  53.22 
 
 		 514 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  52.09 
 
 		 624 aa  498  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>