More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0438 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
504 aa  1028    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  71.83 
 
 
504 aa  756    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  87.52 
 
 
504 aa  899    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  76.14 
 
 
506 aa  786    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  70.58 
 
 
520 aa  741    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  58.52 
 
 
516 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 
527 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  56.86 
 
 
507 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 
532 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  57.43 
 
 
515 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55 
 
 
505 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 
513 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 
515 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  56.4 
 
 
516 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 
525 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  56.43 
 
 
511 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 
514 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 
516 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 
516 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  54.78 
 
 
511 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.13 
 
 
517 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  55.09 
 
 
517 aa  524  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  54.08 
 
 
514 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 
536 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  54.1 
 
 
541 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 
516 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 
513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 
509 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 
531 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 
522 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.24 
 
 
508 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  52.45 
 
 
536 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  52.45 
 
 
536 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.21 
 
 
530 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.29 
 
 
505 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 
514 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  53.95 
 
 
541 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 
512 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 
524 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.78 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 
515 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 
540 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 
513 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 
524 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 
509 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  53.09 
 
 
515 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 
523 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 
516 aa  501  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 
546 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 
523 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  50.48 
 
 
539 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50.58 
 
 
539 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 
512 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 
507 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 
523 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  52.31 
 
 
536 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 
516 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 
518 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 
518 aa  492  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 
519 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 
513 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
514 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.05 
 
 
522 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 
513 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 
523 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 
524 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 
515 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 
516 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  48.42 
 
 
524 aa  487  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 
522 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 
515 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 
521 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 
515 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 
521 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
546 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 
508 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
523 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 
526 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  48.28 
 
 
555 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
546 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 
532 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 
513 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 
515 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 
510 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 
523 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 
513 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>