More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1906 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  82.17 
 
 		 519 aa  891    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 519 aa  1061    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  58.32 
 
 		 516 aa  594  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  53.63 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  53.63 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  52.42 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  51.61 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  51.21 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.45 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  51.22 
 
 		 540 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  52.64 
 
 		 536 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.67 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  49.14 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.95 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.05 
 
 		 541 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.15 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  48.78 
 
 		 539 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  48.78 
 
 		 539 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  48.99 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  49.52 
 
 		 555 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  48.29 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  47.23 
 
 		 515 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 		 528 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  47.82 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  48.57 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.23 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  47.54 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  48.58 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  47.23 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  47.7 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  46.84 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  46.43 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  47.09 
 
 		 523 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  47.09 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  47.57 
 
 		 511 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  49.43 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  47.54 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 		 520 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  47.92 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  48.02 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  48.41 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  48.03 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  47.43 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  50.51 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  47.38 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  47.23 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 512 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  48.71 
 
 		 519 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  47.48 
 
 		 518 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  46.59 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  48.14 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  46.69 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  47.7 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  47.59 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  47.62 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  48.12 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  46.76 
 
 		 515 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  45.96 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  48.08 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  48.22 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  46.28 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>