More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3129 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 510 aa  1023    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  60.93 
 
 		 528 aa  598  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.53 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.53 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  53.63 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 		 525 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  55.65 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  51.01 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  52.24 
 
 		 556 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 516 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  51.85 
 
 		 556 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  51.95 
 
 		 555 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  51.5 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 		 503 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  51.01 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 522 aa  498  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  51.11 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  48.69 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 508 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  53.72 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 515 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  48.33 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  51.78 
 
 		 537 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 524 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 520 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 539 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 520 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  47.92 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  47.88 
 
 		 506 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 531 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  49.39 
 
 		 510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  48.15 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  48.08 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  47.99 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 519 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  47.88 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  47.68 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  47.85 
 
 		 523 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  48.79 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  48.47 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  47.88 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  48.05 
 
 		 523 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  48.26 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 517 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  47 
 
 		 506 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  48.05 
 
 		 523 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  50.61 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  48.18 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>