More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1939 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  83.58 
 
 		 539 aa  914    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  82.68 
 
 		 539 aa  915    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  70.75 
 
 		 531 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  93.52 
 
 		 540 aa  980    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 540 aa  1091    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  82.3 
 
 		 546 aa  892    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  74.62 
 
 		 540 aa  787    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  72.21 
 
 		 541 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  70.11 
 
 		 536 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  89.78 
 
 		 540 aa  943    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  69.41 
 
 		 530 aa  744    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  82.83 
 
 		 536 aa  898    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  68.41 
 
 		 541 aa  756    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 536 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  81.73 
 
 		 546 aa  909    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 536 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  82.18 
 
 		 546 aa  896    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  81.92 
 
 		 546 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 556 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 505 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  56.36 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  56.16 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  54.28 
 
 		 568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  56.36 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  53.95 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 503 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 555 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 505 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 532 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  51.86 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  54.92 
 
 		 516 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  51.25 
 
 		 521 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 		 513 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  54.11 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  51.83 
 
 		 520 aa  508  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 522 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  53.53 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  51.66 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  51.92 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  54.88 
 
 		 510 aa  505  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  54.79 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  52.37 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  51.94 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  51.72 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  54.79 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 519 aa  498  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 519 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  51.26 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  51.92 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  50.82 
 
 		 663 aa  495  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  52.34 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  50.48 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  51.09 
 
 		 624 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  51.04 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  52.83 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  50.19 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  52.02 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  51.83 
 
 		 512 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  50.09 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  52 
 
 		 513 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  47.46 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  51.25 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  51.93 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>