More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0599 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 516 aa  1043    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  61.12 
 
 		 519 aa  611  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  57.97 
 
 		 532 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  58.32 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  58.13 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  56.71 
 
 		 509 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.71 
 
 		 517 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  52.42 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.79 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.81 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.21 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  51.4 
 
 		 503 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 		 528 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.38 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  52.42 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  52.22 
 
 		 556 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  53.31 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  53.2 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 536 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 536 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  52.81 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 523 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 555 aa  498  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 546 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 522 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  50.94 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  53.16 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 514 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  51.84 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  52.1 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  51.36 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  48.5 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  51.26 
 
 		 530 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  52.6 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  48.71 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  50.66 
 
 		 568 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  51.11 
 
 		 524 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  51.93 
 
 		 546 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 512 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  51.93 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  48.6 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 		 519 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  48.71 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  51.15 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 		 520 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 		 525 aa  478  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>