More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2153 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  74.21 
 
 		 513 aa  745    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  78.91 
 
 		 514 aa  845    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  67.51 
 
 		 513 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  67 
 
 		 515 aa  688    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  74.02 
 
 		 513 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  69 
 
 		 513 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  69.79 
 
 		 515 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  72.5 
 
 		 511 aa  770    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  68 
 
 		 512 aa  693    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 516 aa  1058    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  69.79 
 
 		 515 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  76.97 
 
 		 511 aa  821    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  68.95 
 
 		 514 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  68.24 
 
 		 512 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  74.07 
 
 		 514 aa  794    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  69.92 
 
 		 514 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  76.18 
 
 		 510 aa  791    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  69.79 
 
 		 515 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  68.1 
 
 		 513 aa  693    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  65.88 
 
 		 512 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  73.08 
 
 		 515 aa  758    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  71.65 
 
 		 515 aa  745    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  65.75 
 
 		 513 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  69.26 
 
 		 515 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  69.79 
 
 		 515 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  69.2 
 
 		 513 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  67 
 
 		 515 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  69.46 
 
 		 515 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  69.53 
 
 		 514 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  67.91 
 
 		 513 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  68 
 
 		 512 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  72.29 
 
 		 516 aa  777    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  74.21 
 
 		 513 aa  745    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  69.14 
 
 		 514 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  75.44 
 
 		 517 aa  804    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  67.32 
 
 		 513 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  69.92 
 
 		 514 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  72.07 
 
 		 515 aa  754    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  69.53 
 
 		 514 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  69.53 
 
 		 514 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  65.03 
 
 		 513 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  74.02 
 
 		 511 aa  785    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  71.18 
 
 		 527 aa  756    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  74.03 
 
 		 516 aa  799    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  68.82 
 
 		 512 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  66.08 
 
 		 512 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  68.04 
 
 		 512 aa  707    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  63.73 
 
 		 512 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  75.19 
 
 		 516 aa  805    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  69.32 
 
 		 516 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  67.12 
 
 		 513 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 		 527 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  60.83 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  56.42 
 
 		 532 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  55.53 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 		 524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  58.85 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  58.6 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  58.86 
 
 		 532 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  56.29 
 
 		 523 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  54.71 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  55.15 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  56.27 
 
 		 529 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  60.2 
 
 		 516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  56.69 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 529 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 529 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  54.95 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  59.19 
 
 		 519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  59.24 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  58.2 
 
 		 507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 524 aa  571  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 524 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  57.29 
 
 		 507 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  55.19 
 
 		 519 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 521 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  57 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  54.94 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  58.79 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  58.18 
 
 		 518 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  56.31 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  55.67 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  58.87 
 
 		 515 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  58.87 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  56.46 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  57.92 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 505 aa  558  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  53.89 
 
 		 524 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  55.62 
 
 		 527 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  57.03 
 
 		 520 aa  558  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  57.52 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 505 aa  555  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 519 aa  551  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  53.53 
 
 		 520 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  56.92 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>