More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2742 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  82.78 
 
 		 512 aa  872    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  71.29 
 
 		 513 aa  721    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  81.8 
 
 		 512 aa  836    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  98.45 
 
 		 515 aa  1045    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 515 aa  1056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  83.4 
 
 		 519 aa  862    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  76.04 
 
 		 518 aa  805    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  87.67 
 
 		 516 aa  905    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  57.93 
 
 		 532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  58.55 
 
 		 508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  57.87 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  57.6 
 
 		 517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  57.29 
 
 		 507 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  55.84 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  56.74 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  55.02 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 		 511 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  56.45 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  59.51 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  56.97 
 
 		 513 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.33 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  59.08 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  58.75 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 		 511 aa  551  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  58.67 
 
 		 516 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  58.08 
 
 		 510 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 521 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  52.43 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  55.11 
 
 		 527 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  56.55 
 
 		 517 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  58.47 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  55.78 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  55.62 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  54.53 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  55.78 
 
 		 524 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  52.75 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 521 aa  532  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  54.44 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  55.94 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  53.98 
 
 		 532 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  54.69 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 518 aa  526  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  52.96 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  55.85 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  51.96 
 
 		 524 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  51.75 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  53.78 
 
 		 523 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  54.89 
 
 		 515 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  53.96 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  57.34 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 519 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  53.78 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 541 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 510 aa  512  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  52.78 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 519 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 514 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  51.53 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  52.26 
 
 		 527 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.84 
 
 		 530 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 520 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  52.38 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>