More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1111 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02609  2-isopropylmalate synthase  86.43 
 
 
491 aa  863    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
519 aa  1070    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  82.44 
 
 
528 aa  843    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  99.23 
 
 
519 aa  1063    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 
516 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 
523 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 
523 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 
523 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 
521 aa  481  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 
522 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  46.79 
 
 
507 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  46.57 
 
 
499 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  47.72 
 
 
521 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  47.52 
 
 
519 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  47.29 
 
 
513 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  46.99 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  46.89 
 
 
505 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  47.53 
 
 
520 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  47.18 
 
 
508 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 
511 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  46.89 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  46.69 
 
 
505 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  47.18 
 
 
514 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  46.57 
 
 
508 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  45.89 
 
 
507 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  47.13 
 
 
517 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  44.63 
 
 
556 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  46.81 
 
 
536 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  46.35 
 
 
520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  46.89 
 
 
516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  44.63 
 
 
556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  46.95 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  45.66 
 
 
506 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  46.88 
 
 
518 aa  449  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  45.66 
 
 
506 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  47.47 
 
 
513 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  47.47 
 
 
516 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  47.47 
 
 
511 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 
500 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  46.12 
 
 
527 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  46.62 
 
 
536 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  45.96 
 
 
520 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  45.05 
 
 
506 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 
509 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  47.27 
 
 
511 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  47 
 
 
505 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  46.62 
 
 
536 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  45.4 
 
 
532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  47.15 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  46.37 
 
 
514 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 
506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  45.07 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 
506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  47.09 
 
 
526 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  45.76 
 
 
520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  46.09 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0287  2-isopropylmalate synthase  46.81 
 
 
529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.444941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  45.7 
 
 
527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  46.86 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  46.89 
 
 
541 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  46.65 
 
 
524 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 
506 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  45.53 
 
 
521 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  47.06 
 
 
515 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  45.21 
 
 
500 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  46.28 
 
 
524 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  46.57 
 
 
517 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  47.41 
 
 
505 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  45.51 
 
 
515 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  46.88 
 
 
515 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  46.28 
 
 
512 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  47.26 
 
 
515 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  43.8 
 
 
511 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  46.06 
 
 
524 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  45.04 
 
 
516 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  46.15 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1453  2-isopropylmalate synthase  45.01 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  44.86 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  43.96 
 
 
515 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  46.26 
 
 
524 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  45.44 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  44.78 
 
 
555 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  45.84 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  47.39 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1123  2-isopropylmalate synthase  45.05 
 
 
506 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  45.24 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  43.76 
 
 
509 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  43.76 
 
 
509 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  47.34 
 
 
513 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  45.67 
 
 
514 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  46.48 
 
 
513 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  46.46 
 
 
524 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  45.47 
 
 
514 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  45.47 
 
 
514 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  46.92 
 
 
518 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  45.73 
 
 
512 aa  438  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  47.34 
 
 
513 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>