More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0287 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0287  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
529 aa  1074    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.444941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 
522 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1205  2-isopropylmalate synthase  47.56 
 
 
519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1111  2-isopropylmalate synthase  46.81 
 
 
519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3332  2-isopropylmalate synthase  47.07 
 
 
528 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 
521 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 
524 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  46.69 
 
 
523 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  46.89 
 
 
523 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  46.49 
 
 
523 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
511 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  45.67 
 
 
505 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  44.64 
 
 
507 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  45.49 
 
 
499 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  43.02 
 
 
524 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  46.2 
 
 
513 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  46.18 
 
 
513 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  42.37 
 
 
524 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  46.56 
 
 
516 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02609  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 
491 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  42.94 
 
 
524 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  44.44 
 
 
515 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 
515 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  47.08 
 
 
508 aa  421  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  43.66 
 
 
508 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  45.07 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  45.89 
 
 
516 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  45.35 
 
 
524 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  46.44 
 
 
527 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  44.58 
 
 
514 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  44.31 
 
 
521 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 
532 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  44.22 
 
 
505 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  45.11 
 
 
532 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  44.84 
 
 
517 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  45.29 
 
 
518 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  45.88 
 
 
515 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  44.91 
 
 
512 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  43.63 
 
 
505 aa  411  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 
515 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  44.59 
 
 
515 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  44.59 
 
 
515 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  43.43 
 
 
505 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  44.38 
 
 
520 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  44.09 
 
 
527 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  44.64 
 
 
515 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  45.44 
 
 
509 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  46.44 
 
 
504 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  44.59 
 
 
515 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  46.53 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1520  2-isopropylmalate synthase  44.88 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  43.22 
 
 
536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1311  2-isopropylmalate synthase  45.73 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.855244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1284  2-isopropylmalate synthase  45.51 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1322  2-isopropylmalate synthase  44.38 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1491  2-isopropylmalate synthase  45.73 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  43.79 
 
 
519 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  44.69 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  44.53 
 
 
516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1420  2-isopropylmalate synthase  45.73 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  43.22 
 
 
536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  44.38 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  44.59 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  45.82 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  45.74 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  45.7 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  44.89 
 
 
529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  44.89 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  43.22 
 
 
536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1559  2-isopropylmalate synthase  45.25 
 
 
500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  44.8 
 
 
516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  42.17 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  45.7 
 
 
513 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  44.31 
 
 
512 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1285  2-isopropylmalate synthase  45.51 
 
 
506 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  45.9 
 
 
513 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  44.49 
 
 
524 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  43.91 
 
 
512 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  44.1 
 
 
516 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  44.02 
 
 
514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  42.74 
 
 
527 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  44.02 
 
 
514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  45.19 
 
 
514 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  44.02 
 
 
514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  43.51 
 
 
512 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  43.71 
 
 
512 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  45.51 
 
 
512 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  42.8 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  43.82 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  45.49 
 
 
513 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  44.87 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  44.11 
 
 
512 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  43.82 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3891  2-isopropylmalate synthase  45.26 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  43.61 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  43 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.37 
 
 
515 aa  401  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>