More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0107 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 505 aa  1029    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 508 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 		 520 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  52.4 
 
 		 519 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  51.58 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  51.51 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 515 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 521 aa  504  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.19 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 517 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  50.6 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 509 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 518 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 524 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 541 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  52 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 515 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 525 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  48.12 
 
 		 509 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  47.14 
 
 		 507 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 510 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 		 515 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  48.59 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  47.89 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  48.19 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 540 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  47.23 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>