More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2072 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  84.41 
 
 		 515 aa  904    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  66.08 
 
 		 514 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 513 aa  1048    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  98.83 
 
 		 513 aa  1038    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  70.92 
 
 		 513 aa  729    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  91.81 
 
 		 513 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  79.8 
 
 		 512 aa  845    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  99.22 
 
 		 513 aa  1044    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  68.62 
 
 		 511 aa  718    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  78.12 
 
 		 512 aa  833    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  85.6 
 
 		 515 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 		 511 aa  690    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  85.38 
 
 		 514 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  75.63 
 
 		 515 aa  827    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  65.11 
 
 		 514 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  78.29 
 
 		 512 aa  834    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  66.21 
 
 		 527 aa  679    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  70.18 
 
 		 510 aa  723    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  85.41 
 
 		 515 aa  889    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  85.6 
 
 		 515 aa  890    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  78.06 
 
 		 513 aa  827    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  65.95 
 
 		 513 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  76.63 
 
 		 512 aa  821    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  63.53 
 
 		 515 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  67.32 
 
 		 515 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  77.27 
 
 		 513 aa  827    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  84.8 
 
 		 515 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1018  2-isopropylmalate synthase  86.16 
 
 		 514 aa  895    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  85.6 
 
 		 515 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  91.42 
 
 		 513 aa  951    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  64.84 
 
 		 515 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  85.58 
 
 		 514 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  85.19 
 
 		 514 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  79.05 
 
 		 513 aa  832    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  84.41 
 
 		 516 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  65.63 
 
 		 517 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  84.8 
 
 		 514 aa  878    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  67.51 
 
 		 516 aa  689    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  76.8 
 
 		 515 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  85.58 
 
 		 514 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  65.95 
 
 		 513 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  66.34 
 
 		 516 aa  666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0748  2-isopropylmalate synthase  85.05 
 
 		 409 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  69.59 
 
 		 511 aa  741    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  65.82 
 
 		 516 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  80 
 
 		 512 aa  847    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  78.81 
 
 		 512 aa  841    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  79.6 
 
 		 512 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1118  2-isopropylmalate synthase  85.05 
 
 		 409 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  76.44 
 
 		 512 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  85.58 
 
 		 514 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 		 516 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  57.8 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  54.75 
 
 		 536 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  54.83 
 
 		 521 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  54.75 
 
 		 536 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  57.49 
 
 		 514 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  56.74 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  55.11 
 
 		 523 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.29 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 		 524 aa  537  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  55.11 
 
 		 524 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  54.31 
 
 		 527 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 520 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 519 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  54.91 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  54.72 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 526 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  54.71 
 
 		 519 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  54.38 
 
 		 524 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  55.44 
 
 		 516 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 		 511 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 531 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  54.98 
 
 		 515 aa  522  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 524 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  53.77 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  55.13 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  511  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 		 541 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  54.78 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  52.87 
 
 		 521 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 		 530 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  53.07 
 
 		 518 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 524 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>