More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2666 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  84.64 
 
 		 520 aa  905    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  86.41 
 
 		 520 aa  922    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  63.76 
 
 		 529 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  69.9 
 
 		 527 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2338  2-isopropylmalate synthase  78.37 
 
 		 519 aa  809    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  63.56 
 
 		 529 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  63.33 
 
 		 524 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  86.6 
 
 		 520 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  86.41 
 
 		 520 aa  925    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  70.2 
 
 		 524 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  70.63 
 
 		 521 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  70 
 
 		 524 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  69.69 
 
 		 524 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  77.98 
 
 		 520 aa  828    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  69.65 
 
 		 523 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 521 aa  1062    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  62.97 
 
 		 529 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  74.7 
 
 		 526 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  68.55 
 
 		 532 aa  722    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  85.14 
 
 		 519 aa  908    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  61.65 
 
 		 525 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  65.66 
 
 		 513 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  61.37 
 
 		 524 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  59.92 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  59.68 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4030  2-isopropylmalate synthase  60.56 
 
 		 520 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.800606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  58.86 
 
 		 524 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  56.92 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  55.71 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  56.6 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  56.47 
 
 		 511 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 		 515 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 		 517 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  56.83 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  56.34 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  56.14 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  53.92 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  55.19 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  53.24 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  53.94 
 
 		 511 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 516 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  56.19 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  56.19 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 512 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  54.1 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  53.12 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 527 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  52.93 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  52.93 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  52.93 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  53.65 
 
 		 521 aa  521  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  52.34 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  54.03 
 
 		 516 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  53.09 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1058  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 515 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  52.75 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3626  2-isopropylmalate synthase  53.73 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 		 515 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52.58 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  51.86 
 
 		 515 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  52.73 
 
 		 517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 		 515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  53.56 
 
 		 518 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  51.66 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  52.63 
 
 		 515 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  53.24 
 
 		 513 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2298  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.31 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 515 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 525 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  52.47 
 
 		 513 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  51.12 
 
 		 508 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 507 aa  498  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>