More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0335 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00076  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3524  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00075  hypothetical protein  67.57 
 
 		 523 aa  723    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  70.9 
 
 		 516 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0594  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 524 aa  726    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  66.86 
 
 		 526 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1889  2-isopropylmalate synthase  59.8 
 
 		 511 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  87.93 
 
 		 522 aa  943    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0377  2-isopropylmalate synthase  70.84 
 
 		 515 aa  755    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  89.85 
 
 		 522 aa  961    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  68.38 
 
 		 532 aa  722    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  59.88 
 
 		 511 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  69.88 
 
 		 520 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0393  2-isopropylmalate synthase  85.28 
 
 		 523 aa  931    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  72.27 
 
 		 515 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  69.88 
 
 		 520 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0079  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  69.5 
 
 		 515 aa  750    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0129  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0122  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.624748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0068  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  722    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  69.25 
 
 		 524 aa  756    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0079  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0334  2-isopropylmalate synthase  82.95 
 
 		 522 aa  877    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  89.46 
 
 		 522 aa  957    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0129  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0125  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.16499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  69.88 
 
 		 519 aa  764    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0392  2-isopropylmalate synthase  67.58 
 
 		 517 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  68.58 
 
 		 532 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  88.51 
 
 		 522 aa  950    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  88.12 
 
 		 522 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4550  2-isopropylmalate synthase  85.85 
 
 		 523 aa  936    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.518555  normal  0.0133708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3820  2-isopropylmalate synthase  86.4 
 
 		 522 aa  932    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0471  2-isopropylmalate synthase  89.85 
 
 		 522 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  71.29 
 
 		 544 aa  759    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  89.46 
 
 		 522 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0622  2-isopropylmalate synthase  67.37 
 
 		 523 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  86.23 
 
 		 523 aa  938    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  88.31 
 
 		 522 aa  948    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0077  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 522 aa  1081    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3583  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  71.98 
 
 		 519 aa  772    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0081  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0632  2-isopropylmalate synthase  67.77 
 
 		 525 aa  721    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  69.88 
 
 		 520 aa  759    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0124  2-isopropylmalate synthase  67.57 
 
 		 523 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.041588 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  59.8 
 
 		 511 aa  638    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  89.27 
 
 		 522 aa  956    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  88.72 
 
 		 523 aa  957    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 509 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 516 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 525 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  49.22 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 522 aa  485  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 527 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 515 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 522 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  47.42 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  47.9 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  47.9 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  48.46 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1286  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1424  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1279  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1050  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  47.64 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  47.98 
 
 		 521 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>