More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3559 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 528 aa  1064    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  60.66 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  53.52 
 
 		 517 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 505 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  54.38 
 
 		 505 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.97 
 
 		 505 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 		 532 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  53.18 
 
 		 556 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  52.81 
 
 		 556 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1529  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 516 aa  524  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 525 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 509 aa  525  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 530 aa  507  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  51.26 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  51.75 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  54.78 
 
 		 568 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 546 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.72 
 
 		 541 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 519 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 515 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.91 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 515 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  51.79 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.59 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 523 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 522 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  51.55 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  51.47 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  50.38 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  47.95 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 532 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  47.46 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 511 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  48.28 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 		 518 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 540 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 540 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 520 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  51.52 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  49 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  51.3 
 
 		 517 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  48.3 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  47.66 
 
 		 506 aa  472  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 521 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  49.1 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 		 504 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 		 519 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  47.59 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  48.51 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>