More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11561 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  81.92 
 
 		 539 aa  895    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  69.47 
 
 		 536 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  81.36 
 
 		 536 aa  874    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  81.63 
 
 		 539 aa  899    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  69.81 
 
 		 531 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  69.83 
 
 		 530 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0727  2-isopropylmalate synthase  81.54 
 
 		 540 aa  866    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  81.92 
 
 		 540 aa  892    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  90.84 
 
 		 546 aa  994    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  71.18 
 
 		 540 aa  751    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 546 aa  1111    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  70.19 
 
 		 536 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  70.8 
 
 		 541 aa  757    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  69.67 
 
 		 541 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  79.85 
 
 		 540 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  70.19 
 
 		 536 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  90.48 
 
 		 546 aa  1016    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  90.48 
 
 		 546 aa  989    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  54.68 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  54.6 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  56.64 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  57.03 
 
 		 505 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  55.73 
 
 		 517 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  52.97 
 
 		 568 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 555 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  54.81 
 
 		 503 aa  551  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  52.88 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.64 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 		 509 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  53.36 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 505 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  52.2 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  53.11 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 522 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  52.19 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 515 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 517 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 518 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.95 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.96 
 
 		 521 aa  505  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  51.23 
 
 		 527 aa  505  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  52.83 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  51.94 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.51 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  50.76 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  50.58 
 
 		 522 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 513 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  50.38 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  50.19 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  51.85 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  50.67 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44618  2-isopropylmalate synthase  49.63 
 
 		 663 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 524 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  51.33 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 523 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 511 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  50.96 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 523 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  50.19 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  49.33 
 
 		 537 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  48.16 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  48.81 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  51.32 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  49.23 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  49.05 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  48.29 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  48.65 
 
 		 507 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 512 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  48.36 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0586  2-isopropylmalate synthase  47.8 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.237599  hitchhiker  0.000000030119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  48.26 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 510 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>