More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1589 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  66.67 
 
 		 515 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 510 aa  1040    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  57.49 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  56.94 
 
 		 532 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  55.18 
 
 		 508 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  57.06 
 
 		 507 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  55.47 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 		 517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.98 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.21 
 
 		 509 aa  535  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  54.56 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  52.18 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  54.09 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  51.4 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 511 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 		 516 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 515 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 499 aa  509  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  51.05 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 536 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 519 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 519 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.63 
 
 		 541 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  52.91 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 539 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.69 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  51.9 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 530 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 546 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  50.79 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  50.96 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  50.49 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 		 503 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  49.01 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  46.45 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  49.13 
 
 		 536 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  46.88 
 
 		 523 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  49.1 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.41 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  47.04 
 
 		 523 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  46.72 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 546 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  50.91 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1906  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.115585  hitchhiker  0.0000778681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  46.07 
 
 		 556 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  46.84 
 
 		 523 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  48.7 
 
 		 521 aa  481  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 		 528 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09181  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 540 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  47.46 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  47.63 
 
 		 521 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0815  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 515 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2176  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>