More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0740 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 537 aa  1082    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 522 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  53.35 
 
 		 522 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  54.04 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 523 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 523 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2523  2-isopropylmalate synthase  51.34 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.735275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  50.87 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  50.67 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  50.38 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  50.38 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  49.54 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 513 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 527 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.53 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  50.39 
 
 		 532 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  49.44 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  49.62 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 		 517 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  49.14 
 
 		 539 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 		 531 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  49.14 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  50.38 
 
 		 530 aa  478  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  47.68 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 510 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  51.07 
 
 		 517 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4862  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1948  2-isopropylmalate synthase  49.23 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  48.33 
 
 		 555 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2888  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110293 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  50.85 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  49.71 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  46.76 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1774  2-isopropylmalate synthase  49.04 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  48.74 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  49.04 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  48.85 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  48.25 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  48.67 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2101  2-isopropylmalate synthase  49.03 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0462257  normal  0.390804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  48.34 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  47.77 
 
 		 509 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3108  2-isopropylmalate synthase  48.85 
 
 		 512 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 		 516 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  48.15 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0953  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 513 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  47.29 
 
 		 520 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1900  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183482  normal  0.348361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2322  2-isopropylmalate synthase  49.14 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0918  2-isopropylmalate synthase  50.68 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.711845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  47.35 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 524 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  45.79 
 
 		 506 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 522 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11241  2-isopropylmalate synthase  49.52 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.364831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1721  2-isopropylmalate synthase  48.08 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0714728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  47.15 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2072  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  47.67 
 
 		 528 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2223  2-isopropylmalate synthase  49.42 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  48.63 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  47.96 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  48.42 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>