More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28701 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  100 
 
 		 451 aa  930    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  84.28 
 
 		 419 aa  727    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  76.38 
 
 		 445 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  72.08 
 
 		 491 aa  597  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  54.45 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  50.54 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  50.81 
 
 		 376 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  50.54 
 
 		 376 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  50.54 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  51.21 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  50.96 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  47.66 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  48.64 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  35.23 
 
 		 393 aa  224  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  36.18 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  34.29 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  33.16 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  33.79 
 
 		 386 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  33.75 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  33.6 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  32.12 
 
 		 386 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  31.9 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  32.98 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  30.63 
 
 		 386 aa  196  9e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  33.07 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  32.97 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  33.07 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  29.83 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.27 
 
 		 514 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  31.25 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  31.89 
 
 		 514 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  30.65 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  31.93 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  29.83 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  31.12 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  31.77 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  32.04 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  31 
 
 		 381 aa  183  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  31.53 
 
 		 485 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  32.4 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  32.19 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  30.94 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  32.13 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  30.33 
 
 		 505 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  30 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  31.54 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  29.95 
 
 		 502 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  33.72 
 
 		 394 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  31.81 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  30.19 
 
 		 383 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  30.11 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  30.73 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  31.45 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  29.51 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  31.03 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  31.37 
 
 		 448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  30.71 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  30.48 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  30.22 
 
 		 412 aa  173  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  29.33 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  31.44 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  29.69 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  30.46 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  31.32 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  28.96 
 
 		 390 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  30.42 
 
 		 500 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  30.66 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  32.58 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  29.77 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  31.68 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  27.79 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  31.07 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  31.82 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  33.14 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  29.62 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  30.73 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  31.87 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  28.11 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  28.26 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  27.73 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  31.14 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.65 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  32.35 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  29.26 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  28.15 
 
 		 380 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4159  isopropylmalate/homocitrate synthase  33.11 
 
 		 336 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  30.87 
 
 		 503 aa  156  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  29.82 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  28.02 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2142  trans-homoaconitate synthase  32.76 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  27.79 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  28.21 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  28.42 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  30.11 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  29.07 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  28.5 
 
 		 513 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  28.21 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  30.13 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>