More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1257 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  100 
 
 		 389 aa  796    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  58.24 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  57.98 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  57.98 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  57.45 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  55.97 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  53.1 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  52.93 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  50.54 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  48.96 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  47.66 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  47.48 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  49.41 
 
 		 377 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  33.51 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  32.6 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  33.06 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  32.6 
 
 		 514 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  33.98 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  35.31 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  32.21 
 
 		 489 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  34.53 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  32.53 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  31.61 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  33.06 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  33.8 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  31.76 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  31.61 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  30.29 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  31.69 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  31.64 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  30.87 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  30.93 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  33.61 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.49 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  30.85 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  30.34 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  31.22 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  33.05 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  30.4 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  31.73 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  30.56 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  30.38 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  29.94 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  29.46 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  30 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  29.68 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  29.2 
 
 		 522 aa  162  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  31.28 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  30.62 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  30.59 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28.8 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  29.1 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  29.73 
 
 		 492 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  29.1 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  29.25 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  29.65 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2032  2-isopropylmalate synthase  29.69 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  29.4 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  29.39 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  29.56 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  30.62 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  28.99 
 
 		 492 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  29.04 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  29.41 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  30.92 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  28.33 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  28.93 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  27.98 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  29.64 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  29.25 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  27.22 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.49 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  28.72 
 
 		 492 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  29.84 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3757  2-isopropylmalate synthase  29.31 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  28.53 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  29.71 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  28.82 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  28.57 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1102  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  29.77 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  28.95 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  29.51 
 
 		 485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  28.85 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  28.01 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  29.48 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  26.11 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  30.17 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  28.32 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  30.98 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  27.72 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  29.01 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  26.83 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  30.05 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  29.89 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  29.82 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  29.49 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  26.3 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  28.24 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>