More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1398 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 378 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  58.04 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  59 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  54.72 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  54.72 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  58.52 
 
 		 381 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  54.96 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  53.48 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  51.74 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  51.6 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  55.46 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  52.33 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  52.32 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  49.59 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  52.84 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  49.32 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  50.99 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  47.08 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  48.9 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  49.58 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  50.14 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  49.73 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  49.46 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  50.84 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  45.41 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  45.3 
 
 		 377 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  49.57 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  46.65 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  51.1 
 
 		 402 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  44.29 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  47.28 
 
 		 377 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  47.84 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  44.89 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  48.63 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  49.15 
 
 		 389 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  46.42 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  50.28 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  53.06 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  42.39 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  44.99 
 
 		 377 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  44.99 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  45.38 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  46.03 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  45.2 
 
 		 381 aa  311  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  45.35 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  45.2 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  46.38 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  45.01 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  45.88 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  46.2 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  42.74 
 
 		 381 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  45.11 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  43.32 
 
 		 375 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  43.77 
 
 		 413 aa  272  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  38.96 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3580  homocitrate synthase  48.74 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483441  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  46.33 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  38.48 
 
 		 492 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  38.59 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  37.94 
 
 		 492 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.21 
 
 		 492 aa  259  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  40.33 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  48.34 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  37.67 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.11 
 
 		 500 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  39.88 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.47 
 
 		 504 aa  245  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  48.31 
 
 		 287 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  40.64 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  38.92 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  40.11 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  38.62 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  39.64 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  39.78 
 
 		 406 aa  242  6e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  38.67 
 
 		 514 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  37.13 
 
 		 405 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0409  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000285195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  39.14 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  41.45 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  36.83 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36.21 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  38.46 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.65 
 
 		 485 aa  235  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  37.06 
 
 		 514 aa  235  9e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  38.24 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  35.12 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  40.67 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.82 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  41.07 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  39.26 
 
 		 517 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  38.55 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  37.6 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  41.69 
 
 		 508 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  39.77 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.69 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  40.76 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  36.95 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  37.43 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>