More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0947 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0947  homocitrate synthase  100 
 
 		 384 aa  782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01990  homocitrate synthase, mitochondrial precursor (Eurofung)  53.68 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2761  homocitrate synthase  55.61 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.258866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1436  homocitrate synthase  51.6 
 
 		 376 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2511  homocitrate synthase  51.07 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2424  homocitrate synthase  51.07 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.965595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1257  homocitrate synthase  53.1 
 
 		 389 aa  414  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.943994  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_006686  CND01200  homocitrate synthase, putative  54.3 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89386  homocitrate synthase  53.35 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2393  homocitrate synthase  49.47 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.310246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3301  pyruvate carboxyltransferase  56.12 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0533542  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28701  homocitrate synthase  51.21 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.453642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3603  pyruvate carboxyltransferase  50.27 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  36.99 
 
 		 460 aa  225  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  37.29 
 
 		 489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  36.51 
 
 		 376 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  35.11 
 
 		 475 aa  212  9e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  35.44 
 
 		 514 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  32.97 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1957  homocitrate synthase  35.42 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  34.06 
 
 		 514 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  33.79 
 
 		 514 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  34.15 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  33.61 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  33.24 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1293  pyruvate carboxyltransferase  35.03 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0122344 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  34.34 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.11 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0445  pyruvate carboxyltransferase  31.79 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.0329484 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0826  2-isopropylmalate synthase  34.26 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2729  pyruvate carboxyltransferase  32.88 
 
 		 412 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  33.06 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1595  2-isopropylmalate synthase  33.73 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  33.33 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  32.87 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  35.01 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  33.33 
 
 		 520 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  33.7 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  32.77 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  32.6 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  32.77 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  34.08 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  32.6 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  31.43 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  34.06 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  31.84 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  32.77 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  32.09 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  29.75 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  30.17 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  32.87 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  30.52 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  31.38 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  32.02 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  31.44 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.61 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  30.45 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  31.44 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1323  2-isopropylmalate synthase  30.05 
 
 		 513 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  30.68 
 
 		 525 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  32.35 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  30.99 
 
 		 492 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2787  2-isopropylmalate synthase  30.41 
 
 		 394 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  32.21 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.78 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  31.35 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  32.16 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  33.14 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  29.44 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  31.52 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  30 
 
 		 505 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  30.7 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  31.28 
 
 		 522 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  29.41 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  32.74 
 
 		 511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  33.14 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  30.87 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  30.64 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  32.16 
 
 		 515 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  32.08 
 
 		 517 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  29.41 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  30.46 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  32.34 
 
 		 507 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  31.25 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  31.48 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  30.98 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  31.25 
 
 		 523 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  31.25 
 
 		 377 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  30.97 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  28.96 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  31 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  31.28 
 
 		 504 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  31.07 
 
 		 509 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  30.98 
 
 		 523 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  33.43 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  32.51 
 
 		 504 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  29.76 
 
 		 490 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  30.71 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  31.09 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>